Die Abenteuer von zwei Jungen und einem klugen Delfin gehen in die dritte Staffel. Der fünfzehnjährige Sandy (Luke Halpin) und der zehnjährige Bud (Tommy Norden) sind die Söhne des verwitweten Parkaufsehers Porter Ricks (Brian Kelly). Dessen Aufgabe ist es, im Coral Key Park in Florida für die Sicherheit der Delfine und der Taucher zu sorgen. Die drei freunden sich mit dem Delfin Flipper an, der für die beiden Jungen ein Spielkamerad und für Porter eine unentbehrliche Hilfe bei seiner täglichen Arbeit ist. Gemeinsam erleben sie eine Menge Abenteuer im Park, denn nicht selten machen zwielichtige Gestalten die Gegend unsicher und es gilt Schmugglern und Umweltsündern das Handwerk zu legen. Unterstützt werden sie dabei von dem alten Seebären Hap Gorman (Andy Devine) und der Meeresbiologin Ulla (Ulla Strömstedt).

Episodenübersicht der 3. Staffel:
61. Das Flugzeugwrack (Agent Bud)
62. In der Falle, Teil 1 (Disaster in the Everglades, Part 1)
63. In der Falle, Teil 2 (Disaster in the Everglades, Part 2)
64. Budd hat Sorgen (Lost Dolphin)
65. Sturmwarnung (The Warning)
66. Das Mädchen Janny (Cupid Flipper)
67. Der Auftrag (An Errand For Flipper)
68. Die Jagd auf den Wal (Whale Ahoy)
69. Die Explosion (Explosion)
70. Bud und seine Freunde (Executive Bud)
71. Der kleine Hund (Flipper And The Puppy)
72. Die Insel (Flippers Island)
73. Der Kampf mit dem Alligator (Alligator Duel)
74. Auf der Flucht, Teil 1 (Flipper and the Fugitive, Part 1)
75. Auf der Flucht, Teil 2 (Flipper and the Fugitive, Part 2)
76. Ein sehr teurer Fisch (The Most Expensive Sardine In The World)
77. Der Muschelräuber (Flipper And The Seal)
78. Ein Delphin darf nicht schlafen (Dolphins Dont Sleep)
79. Der Besuch (Aunt Martha)
80. Die Entführung (Dolphin for Ransom)
81. Das Experiment (A Dolphin In Time)
82. Entscheidungen (Decision For Bud)
83. In höchster Gefahr, Teil 1 (The Firing Line, Part 1)
84. In höchster Gefahr, Teil 2 (The Firing Line, Part 2)
85. Der Teufelsrochen (Devil Ray)
86. Der Papagei (Capn Flint)
87. Neue Freunde, Teil 1 (Flippers New Friends, Part 1)
88. Neue Freunde, Teil 2 (Flippers New Friends, Part 2)