La leche y sus derivados son uno de los principales componentes de la industria ganadera nacional. Sin embargo, la cadena de producción de estos productos es susceptible de presentar una serie de defectos, especialmente en lo que se refiere a la contaminación por sustancias no deseadas, en particular residuos de medicamentos antimicrobianos y micotoxinas, que pueden desencadenar cuadros patógenos en el ser humano y provocar complicaciones tecnológicas durante la elaboración de los productos lácteos. A lo largo de los años, se han desarrollado diversas tecnologías que utilizan microorganismos fermentadores con el objetivo de minimizar o eliminar estos compuestos tanto en el ganado como en la leche. Los microorganismos probióticos, concretamente las levaduras y las bacterias lácticas, desempeñan un papel crucial en estas tecnologías debido a su reconocida inocuidad, notable capacidad de adsorción e impacto beneficioso sobre la salud del huésped, lo que permite incorporarlos a las formulaciones y dietas alimentarias. Este estudio abre perspectivas para el descubrimiento y utilización de nuevas cepas con potencial aplicabilidad en la eliminación de contaminantes de matrices alimentarias y en la producción de metabolitos secundarios de interés industrial.